Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChgaP26339 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms