Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Znf239P24399 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms