Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms