Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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