Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a2P20490 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms