Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Fcer1aP20489 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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