Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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