Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18528 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18528 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18528 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18528 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18528 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18528 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms