Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms