Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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