Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cxcl2P10889 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cxcl2P10889 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cxcl2P10889 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cxcl2P10889 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms