Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms