Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms