Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01790 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01790 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01790 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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