Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms