Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FxnO35943 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms