Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk2O35491 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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