Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kpna3O35344 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kpna3O35344 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms