Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcns1O35173 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms