Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Degs1O09005 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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