Protein–RNA interactions for Protein: O08970

Tuft1, Tuftelin, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuft1O08970 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuft1O08970 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms