Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Casp12O08736 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Casp12O08736 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Casp12O08736 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp12O08736 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Casp12O08736 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms