Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ascl4M0QW46 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ascl4M0QW46 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms