Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm8888J3QPX5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms