Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm8356J3QPD3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms