Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms