Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim18J3QNP2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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