Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc180J3QNE4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms