Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6594J3QM43 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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