Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34c3J3QJW5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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