Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21863J3KMP8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21863J3KMP8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21863J3KMP8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21863J3KMP8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms