Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms