Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28038F7BCN9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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