Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28048F7BCN0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms