Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8005F6YKY3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms