Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm8247F6VRJ8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm8247F6VRJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms