Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms