Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Herc6F2Z461 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Herc6F2Z461 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms