Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms