Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms