Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MccE9PWI3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MccE9PWI3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms