Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms