Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms