Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SafbD3YXK2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms