Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms