Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2B9EJA2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms