Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms