Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud7bB2RUR8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms