Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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