Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf1B2RRD7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms